南昌市卫生学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。卫生学校的毕业证书是针对医学相关领域的学习证明，而普通高中毕业证书则适用于所有领域。因此，两者的教育和方向不同，其证书效力也存在差异。不过，南昌市卫生学校的毕业证书在医学行业内部是被广泛认可的，对于进入医学领域工作或深造有一定帮助。