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抚州市临川区昌茂职业高级中学颁发的毕业证书与普通高中毕业证书的效力不完全相同。昌茂职业高级中学侧重于职业教育，其毕业证书主要证明学生在特定职业技能方面的掌握。而普通高中毕业证书则更多证明学生完成了基础教育，两者侧重点不同。因此，昌茂职业高级中学的毕业证书在职业技能方面可能更具实效性，但在普通教育层面可能与普通高中证书有所不同。具体效力还需根据社会需求和用人单位认可程度来确定。