吉安市中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力是不同的。中专毕业证书主要证明学生在某一职业技能领域接受过系统教育，具备从事特定职业的基本技能和知识。而普通高中毕业证书则证明学生完成了普通高中的学业，具备基本的文化素养和科学知识。因此，两者并不具有完全等量的效力。对于更具体的认证或应用情况，建议参考教育部门或用人单位的具体要求。