两者的效力并不完全相同。鹰潭应用工程学校颁发的毕业证书更多的是职业教育领域的证明，它主要证明学生在特定职业技能上的掌握程度。而普通高中毕业证书则是基础教育的一部分，更侧重于学术知识和综合素质的培养。因此，虽然鹰潭应用工程学校的毕业证书在某些就业领域具有实用价值，但在某些需要高中基础教育背景的情况下，其效力可能会受到限制。具体情况还需结合实际需求进行考量。