赣州现代科技职业学校的毕业证书与普通高中证书效力不同。普通高中毕业证是参与普通高考、报考传统大学的重要依据，主要通往学术型升学路径。而该校毕业证更多用于证明其在职业学校完成学业，可凭借此参加职业院校单招等，侧重于职业教育与技能培养方向的升学就业，二者在教育体系和发展方向上各有侧重。