龙南中等专业学校毕业证书与普通高中证书效力不同。普通高中毕业证主要反映文化课学习经历，是报考普通高校的依据。而龙南中等专业学校毕业证体现的是中等职业教育经历，在升学上可通过高职单招等途径进入高校，在就业方面，能凭借所学专业技能从事相关技术工作，其作用侧重于职业领域，与普通高中毕业证不具同等效力。