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赣州农业学校（赣县中专）是一所职业中专学校，其毕业证书与普通高中毕业证书在学历层次上是一样的，都具备中等教育程度。但两者教育方向不同，中专更偏向于职业技能培训，而普通高中则注重基础文化教育。因此，虽然都是中等学历，但毕业证书的效力还是有所区别的。具体效力还需根据用人单位的需求和认可程度来确定。