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赣州市军科职业技术学校的助学金申请流程通常包括以下几个步骤：

1. 学生提交申请及相关证明材料。

2. 学校审核学生的家庭经济状况和学习成绩。

3. 审核通过后，学校会在一定时间内公示名单。

4. 助学金发放至学生账户。

关于发放时间，一般是每学期或每年度结束前，确保学生正常学习和生活需要。具体发放时间可能会因学校工作安排和财政拨款进度有所调整，建议学生及时关注学校公告。