赣州农业学校（赣县中专）对于违纪的学生会进行严肃处理。首先，学校会进行违纪情况调查，了解事情的真相。然后，根据违纪的严重程度，学校会采取相应的处罚措施，如警告、记过、留校察看或开除学籍等。同时，学校还会要求学生写检讨书，认识到自己的错误，并予以改正。学校注重教育为主，惩罚为辅，帮助每一位学生纠正错误，回归正轨。整个过程公平、公正、公开，确保处理结果的公正性和合理性。